آیت‌الله مجتهد شبستری از پیشگامان شکل گیری نهضت امام خمینی بود
آیت الله سید ابراهیم رئیسی رئیس جمهور با صدور پیامی ضمن تسلیت درگذشت آیت الله محسن مجتهد شبستری از خداوند متعال برای ایشان علو درجات و همجواری با ائمه اطهار(ع) را مسالت کرد. متن پیام آیت الله رئیسی بدین شرح است:
«بسم‌الله الرحمن الرحیم…